Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRNP3Q8WYN3 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms