Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRRN4Q8WUT4 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms