Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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RNF182Q8N6D2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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RNF182Q8N6D2 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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RNF182Q8N6D2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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RNF182Q8N6D2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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RNF182Q8N6D2 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF182Q8N6D2 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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