Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HS2ST1Q7LGA3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms