Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHDC7AQ5VTJ3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms