Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms