Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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