Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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