Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUL4BQ13620 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms