Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CGNL1Q0VF96 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms