Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms