Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARID5AQ03989 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms