Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ACTBP60709 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299 ms