Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASP7P55210 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASP7P55210 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASP7P55210 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms