Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TMEM256P1-201ENST00000430550 340 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMARCA2P51531 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms