Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP4P49662 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP4P49662 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CASP4P49662 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms