Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACADSBP45954 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms