Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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