Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PPARGP37231 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PPARGP37231 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PPARGP37231 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms