Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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