Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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PRKCHP24723 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PRKCHP24723 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PRKCHP24723 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PRKCHP24723 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PRKCHP24723 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRKCHP24723 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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