Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CSRP1P21291 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms