Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHP20396 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHP20396 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHP20396 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHP20396 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHP20396 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRHP20396 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 GPR141-201ENST00000334425 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 LINC00424-201ENST00000413124 654 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC011773.4-202ENST00000566000 1264 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 MIR4527HG-201ENST00000586905 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRHP20396 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 ASS1P9-201ENST00000513426 1236 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 LINC02074-201ENST00000581028 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 LINC02074-202ENST00000584003 573 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRHP20396 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 LINC00313-206ENST00000441283 448 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 EIF3K-213ENST00000593149 760 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC024580.2-201ENST00000623363 231 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC073578.4-201ENST00000623945 514 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRHP20396 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms