Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM225BP0DP42 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms