Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC192P0DO97 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms