Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
O00370 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
O00370 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
O00370 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
O00370 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
O00370 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
O00370 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
O00370 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
O00370 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
O00370 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
O00370 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
O00370 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
O00370 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
O00370 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
O00370 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
O00370 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms