Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms