Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
SMIM1B2RUZ4 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms