Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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