Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 MOB3C-201ENST00000271139 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNFSF18Q9UNG2 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms