Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TTC7AQ9ULT0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms