Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms