Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TFIP11Q9UBB9 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms