Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RRBP1Q9P2E9 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms