Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C18orf8Q96DM3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms