Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP2A3Q93084 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms