Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC112Q8NEF3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms