Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms