Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms