Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2C1P98194 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms