Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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IRX4P78413 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRX4P78413 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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IRX4P78413 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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IRX4P78413 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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IRX4P78413 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRX4P78413 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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