Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC104794.2-201ENST00000567540 1572 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NDE1P2-201ENST00000605569 1105 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SNTG1-202ENST00000518864 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 UBE2D3-211ENST00000502404 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSEN1P49768 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms