Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC044802.2-201ENST00000551187 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VEGFBP49765 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms