Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 MIR663AHG-218ENST00000598448 804 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NESP48681 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 B3GALNT1-204ENST00000417187 1107 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 AC018868.2-201ENST00000559655 1259 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NESP48681 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 AP001979.1-201ENST00000529222 751 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NESP48681 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NESP48681 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NESP48681 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NESP48681 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NESP48681 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms