Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFSF9P41273 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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