Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCM3P25205 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCM3P25205 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCM3P25205 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCM3P25205 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCM3P25205 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCM3P25205 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCM3P25205 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCM3P25205 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCM3P25205 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCM3P25205 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCM3P25205 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCM3P25205 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCM3P25205 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCM3P25205 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms