Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HRCP23327 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HRCP23327 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HRCP23327 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HRCP23327 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HRCP23327 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HRCP23327 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HRCP23327 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HRCP23327 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HRCP23327 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HRCP23327 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HRCP23327 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HRCP23327 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms