Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBTFP17480 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBTFP17480 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBTFP17480 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBTFP17480 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBTFP17480 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms