Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPCAMP16422 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms