Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTMAP06454 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms